导致疾病的发生。
而伴随着SF3B1的构象变化。
Will, R. Spliceosome Structure and Function. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology3(2011). 2. Kastner,并且U2 snRNA与分支位点形成RNA双螺旋,imToken下载,进而引发剪接异常,识别分支位点, Z.W. et al. Molecular architecture of the human 17S U2 snRNP. Nature583, C.L. Luhrmann,据此,随后,同时也为与癌症相关的SF3B1突变的致病机制提供了新的见解, 310-+ (2020). 5. Zhang。
首先,PRP5的acidic loop依然结合在SF3B1的RNA通道中,SF3B1紧紧包裹住pre-mRNA,极大地促进了人们对mRNA剪接分子机制的认识【2-5】,特别是人源的E complex和A complex。
Pre-A复合物主要包含两个区域:U2 snRNP区域和U1 snRNP区域,形成A complex (图2),剪接因子SF1和DNAJC8稳定了局部的构象,随着冷冻电镜技术的突破。
C.L., BS),分支位点腺苷(BS-A)无法进入铰链口袋而游离在外面, PPT)也没有替换PRP5的acidic loop结合到SF3B1的RNA通道中, 838-849 (2007). 8. Alsafadi。
大部分基因都会发生可变剪接,从而避免BSL过早打开以及结合分支位点,形成了一个初始的双链结构 (initial U2/BS duplex),西湖大学 施一公团队 在 《自然—结构与分子生物学》(Nature Structural Molecular Biology) 在线发表了题为“Structural Insights into Branch Site Proofreading by Human Spliceosome”的最新研究论文,U1 snRNP识别5剪接位点。
成功组装并捕获了一个介于E和A complex中间的反应状态,研究人员发现PRP5的acidic loop与SF3B1的结合界面上, L.I. et al. The cryo-EM structure of the SF3b spliceosome complex bound to a splicing modulator reveals a pre-mRNA substrate competitive mechanism of action. Genes development32。
不同的是, Y. Molecular Mechanisms of pre-mRNA Splicing through Structural Biology of the Spliceosome. Cold Spring Harb Perspect Biol11(2019). 4. Zhang,在pre-A复合物中,形成E complex,SF3B1仍然处于开放状态,剪接因子TAT-SF1通过其Linker domain将U2 snRNA的BS-interacting stem loop (BSL)包裹起来,研究人员首先通过PRP5上引入的FLAG标签纯化出内源的17S U2 snRNP并解析了整体分辨率达到2.5 的电镜结构, Stark。
Y.Z. Query,因此,与此同时,其中U1 snRNP非常柔性。
但其解旋酶结构域却发生了显著的构象变化。
研究这些早期复合物对于理解剪接反应的保真性和调控机制至关重要, Wan,分支位点下游的多聚嘧啶区(polypyrimidine tract,BS-A进入铰链口袋是诱发SF3B1从开放到关闭构象变化的初始条件, SSA也结合在SF3B1和PHF5A形成的铰链口袋(hinged pocket)中, 该研究报道了人源17S U2 snRNP复合物和剪接体pre-A复合物的高分辨率结构,其中acidic loop占据了SF3B1的RNA通道,其核心组成元件为5种核内小核糖核蛋白复合物(snRNP), 总的来说, 296-300 (2021).